據(jù)中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園官方網(wǎng)站消息，該園聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)和北京腦科中心，收集了全球共享到GISAID EpiFluTM數(shù)據(jù)庫中覆蓋四大洲12個(gè)國家的93個(gè)新冠病毒樣本基因組數(shù)據(jù)(截至2月12日)，通過全基因組數(shù)據(jù)解析發(fā)現(xiàn)：武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其它地方傳入。

93個(gè)樣本包含58種單倍型，演化關(guān)系顯示，單倍型H13和H38是比較“古老的”單倍型，通過一個(gè)中間載體(mv1，可能是祖先單倍型，也可能是來自中間宿主或“零號病人”)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關(guān)聯(lián)，并通過單倍型H3衍生出單倍型H1。

研究人員稱，與華南海鮮市場有關(guān)聯(lián)的患者樣品單倍型都是H1及其衍生單倍型H2，H8-H12，而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關(guān)。可見，華南海鮮市場的新冠病毒是從其它地方傳入，再在市場發(fā)生快速傳播并蔓延。另根據(jù)病患發(fā)病時(shí)間記錄和種群擴(kuò)張時(shí)間推斷，也印證了華南海鮮市場不是病毒發(fā)源地的推論。

此外，研究人員對H13和H38的病毒樣品溯源發(fā)現(xiàn)，分別來自深圳的病患(廣東首例)和美國華盛頓州的病患(美國首例)。他們的旅行記錄表明都是2019年12月底至2020年1月初在武漢被感染?，F(xiàn)有武漢樣本中沒有檢測到H13和H38單倍型。

研究還顯示，新冠病毒在2月12日前發(fā)生過2次明顯種群擴(kuò)張：一次是2019年12月8日，該結(jié)果暗示病毒可能在12月初，甚至11月下旬已開始人際傳播，隨后在華南海鮮市場加快；另一次種群擴(kuò)張發(fā)生在1月6日。

值得一提的是，為細(xì)分來源，研究人員將58種單倍型分成五組，包括3個(gè)古老超級傳播者單倍型(H1,H3和H13)和2個(gè)新的超級傳播者單倍型(H56和mv2)。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個(gè)來源，重慶和臺灣的病毒有兩個(gè)來源。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國，患者感染源至少有兩個(gè)，尤其是美國包括了五個(gè)來源。特別值得關(guān)注的是H56這個(gè)超級傳播者單倍型，同時(shí)是澳大利亞、法國和美國以及中國臺灣患者的傳染源。

研究還表明，新冠病毒基因組沒有發(fā)生重組事件。